Рассмотрен экспертный механизм учета человеческого фактора в задачах поддержки принятия управленческих решений при анализе и совершенствовании организационных и социально-экономических систем. Показано, что наиболее адекватным для этой цели является методология коллективной многовариантной экспертизы и классификационного анализа сложноорганизованных данных. В качестве примера эффективного использования такого подхода приводится решение задачи реформирования системы пассажирских автоперевозок в Московской области.