Рассмотрен экспертный механизм учёта человеческого фактора в задачах принятия управленческих решений в крупномасштабных организационных системах. Показано, что наиболее адекватным для этой цели является методология коллективной многовариантной экспертизы. Описаны концепция и основные этапы формирования экспертных комиссий и проведения экспертизы. Рассмотрен вариант заочной многовариантной экспертизы, специально предназначенный для территориально разбросанных крупномасштабных систем. Эффективность разработанной методологии подтверждена в процессе решения многочисленных прикладных задач.