Рассмотрена задача развития теоретико-практических аспектов формирования инновационных систем, с целью внедрения выявленных возможностей в региональную экономику Российской Федерации. Авторами проводится семантический и этимологической анализ понятий национальной и региональной инновационных систем. Исследуются достоинства и недостатки теорий инновационного развития, а также предпосылки возникновения концепции региональных инновационных подсистем (РИпС). Проведен анализ зарубежных моделей национальных инновационных систем (НИС) и выявлены возможности для развития НИС и РИпС в России.