В работе рассматривается влияние проблем государственного управления научно-технологическим комплексом России на ее экономическую безопасность. Описаны и формализованы альтернативные политики управления инновационным развитием – политики легализма и утилитаризма. Предложена модель оценки эффективности выбора политики управления научно-технологическим развитием в зависимости от вероятности создания новой технологии, затрат на исследования и разработки, их длительности в сравнении с жизненным циклом создаваемой новой технологии, экономии затрат при ее внедрении. Для различных сочетаний значений параметров модели рассчитан ожидаемый эффект от внедрения новой технологии за весь жизненный цикл. Определены условия экономической эффективности выбора той или иной политики управления при разработке и внедрении новых технологий. Предложенный подход проиллюстрирован на примере проекта-маяка Почты России по доставке грузов при помощи беспилотных воздушных судов.